Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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