Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Urb2E9Q7L1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms