Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms