Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Susd1E9Q3H4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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