Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc1E9Q043 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms