Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms