Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3298E9PW80 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3298E9PW80 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms