Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms