Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1110002E22RikE0CYV9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms