Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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