Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms