Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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