Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia1B2RXQ2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms