Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms