Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rd3lB2RV38 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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