Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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