Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms