Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 247.3 ms