Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms