Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc163A2AGD7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms