Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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