Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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