Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubl3Q9Z2M6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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