Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms