Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms