Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cldn7Q9Z261 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cldn7Q9Z261 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cldn7Q9Z261 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn7Q9Z261 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn7Q9Z261 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn7Q9Z261 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn7Q9Z261 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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