Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1Q9Z179 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms