Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Sh3bp5Q9Z131 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Sh3bp5Q9Z131 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Sh3bp5Q9Z131 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Sh3bp5Q9Z131 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
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Sh3bp5Q9Z131 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Sh3bp5Q9Z131 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Sh3bp5Q9Z131 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5Q9Z131 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5Q9Z131 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5Q9Z131 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5Q9Z131 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Sh3bp5Q9Z131 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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Sh3bp5Q9Z131 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5Q9Z131 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5Q9Z131 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5Q9Z131 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Sh3bp5Q9Z131 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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