Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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