Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nme3Q9WV85 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nme3Q9WV85 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nme3Q9WV85 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme3Q9WV85 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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