Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms