Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

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Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ptpn4Q9WU22 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms