Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms