Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Kcnip3Q9QXT8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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