Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53inp1Q9QXE4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms