Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms