Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms