Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rabgef1Q9JM13 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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