Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot9Q9JKY0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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