Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp4Q9JKV5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms