Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp5Q9JKD3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms