Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ybx3Q9JKB3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms