Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms