Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms