Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nup50Q9JIH2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nup50Q9JIH2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nup50Q9JIH2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nup50Q9JIH2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nup50Q9JIH2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nup50Q9JIH2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nup50Q9JIH2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nup50Q9JIH2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup50Q9JIH2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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