Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rb1cc1Q9ESK9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms