Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aff4Q9ESC8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms