Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms