Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms