Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms