Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms